SNP-Typisierung (SNP-Chip, Mikroarray)

Kommerzielle SNP-Chips ermöglichen das genomweite parallele Bestimmen von bis zu Hundertausenden Single-nucleotide polymorphism DNA-Sequenzvarianten (SNPs) einer Probe unterschiedlichster Art. Solche hochauflösenden DNA-Profile können sowohl für Abstammungsüberprüfungen als auch für die Genotypisierung kausaler Varianten für Gendefekte (Erbkrankheiten) sowie funktionaler Merkmale (wie Krankheitsresistenzen) parallel herangezogen werden. Außerdem können damit genomische Inzuchtkoeffizienten von Herden und effektive Populationsgrößen abgeschätzt werden. Diese Parameter sind eine Weiterentwicklung der aus Pedigreedaten ermittelten Beurteilungswerte für den Gefährdungsgrad einer Population bzw. Rasse.
In ihrer Gesamtheit eröffnet diese technologische Entwicklung ein Portfolio genombasierter Anwendungen für eine routinemäßige SNP-Genotypisierung jetzt und zukünftig, die in ihrer Gesamtheit zudem eine kostengünstigere Alternative zu Einzelanalysen darstellen kann.