SNP-Typisierung (SNP-Chip, Mikroarray)

Kommerzielle SNP-Chips ermöglichen das genomweite parallele Bestimmen von bis zu Hundertausenden Single-nucleotide polymorphism DNA-Sequenzvarianten (SNPs) einer Probe unterschiedlichster Art. Solche hochauflösenden DNA-Profile können sowohl für Abstammungsüberprüfungen als auch für die Genotypisierung kausaler Varianten für Gendefekte (wie Spinnengliedrigkeit und Mikrophthalmie) sowie funktionaler Merkmale (wie z.B. Scrapie- oder Maedi-Visna-Resistenz) parallel herangezogen werden. Außerdem können damit genomische Inzuchtkoeffizienten von Herden und effektive Populationsgrößen abgeschätzt werden. Diese Parameter sind eine Weiterentwicklung der aus Pedigreedaten ermittelten Beurteilungswerte für den Gefährdungsgrad einer Population bzw. Rasse.
In ihrer Gesamtheit eröffnet diese technologische Entwicklung ein Portfolio genombasierter Anwendungen für eine routinemäßige SNP-Genotypisierung, die in ihrer Gesamtheit zudem eine kostengünstigere Alternative zu Einzelanalysen darstellt.